1. Repositorio Institucional del Tecnológico Nacional de México (RI - TecNM)
2. Tesis de Posgrado
3. Veracruz
4. Instituto Tecnológico Superior de Misantla
5. Tesis de licenciatura
6. ingenieria ambiental

Title:	Detección de regiones conservadas en genes bacterianos responsables de la degradación de hidrocarburos
Authors:	Jaén Landa, José Daniel
metadata.dc.subject.other:	Detección GenesBacterianos Hidrocarburos
Issue Date:	2022-09-19
Publisher:	Tecnológico Nacional de México
metadata.dc.publisher.tecnm:	Instituto Tecnológico Superior de Misantla
Description:	Mediante diversos estudios se han podido conocer varios géneros bacterianos que poseen un caracterizado poder degradativo y de remediación de zonas contaminadas por hidrocarburos, sin embargo, algunas especies bacterianas por su género se encuentran con un restringido uso en ciertos ambientes, debido a que suelen ser patógenas tanto en humanos como en flora o fauna; impidiendo así su aplicación en trabajos de biorremediación. A pesar de estar distanciados filogenéticamente la mayoría de los microorganismos, poseen secuencias similares para una reacción enzimática. En este trabajo se identificaron las regiones conservadas codificantes en diferentes taxas bacterianos con actividad catalítica para una gama de hidrocarburos, generando así, una primera base molecular en la construcción o diseño de un organismo genéticamente modificado viable. En primer lugar, se realizó la búsqueda exhaustiva y el compilado (FASTA) de secuencias parciales y completas de genes que estén involucrados en la degradación de hidrocarburos en la base de datos del Centro Nacional para la Información en Biotecnología (NCBI). Se obtuvieron un total de 512 secuencias nucleotídicas distribuidas entre 54 genes encontrados, para los hidrocarburos alcanos, naftaleno, bifenilo, etilbenceno, fenantreno, pireno, tolueno y xileno, se archivaron para generar una base de datos personal. Posteriormente, con el uso de la herramienta de Búsqueda para Alineamiento Básico Local (BLAST) se ejecutó un primer alineamiento para descartar aquellos genes duplicados o secuencias clonadas bajo otro nombre, en esta etapa se descartaron aproximadamente el 67% de las secuencias. Para la detección de regiones objetivo con extensión de conservación superior a las 50 pb se realizó un segundo alineamiento empleando el software Bioedit. Hasta el momento, el hidrocarburo Naftaleno, se encuentra más caracterizado (12 genes), la secuencia de pares de bases más larga es de 4,355 pb y la más corta de 204 pb. En este proyecto se encontraron un total de 67 regiones conservadas que comprenden extensiones de 50 – 627 pb. Estableciendo un dato bioinformático que a futuro servirá en la construcción de un organismo genéticamente modificado para la degradación de ambientes contaminados con hidrocarburos.
metadata.dc.type:	info:eu-repo/semantics/bachelorThesis
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